故事发生在未来世界之中，在那里，怪盗和侦探是两个同样活跃但相互对立的群体，长久以来，两个群体之间一直维系着相互制约和对抗的微妙平衡。在这样一个动荡的时代中，有一些人拥有着名为“Toys”的特殊能力，拥有这种特殊能力的人们有着比平常人更为缜密的逻辑思维和敏锐的观察能力。天真烂漫活泼可爱的雪莉福德、成熟冷静充满了高贵而优雅的气质的阿蒂尼亚、性格内向沉默寡言十分喜欢读书的艾露克露和个性大大咧咧心直口快的让崎妮洛，这四名拥有特殊能力的少女们展开了和怪盗之间的争斗。

夏洛克、妮洛、艾露克露、柯蒂妮娅四人使用Toys和超群的团队合作解决无数事件的「Holmes侦探学院」的大人气人物。她们组成的「Milky Holmes」不仅是学园的学生还是真个欧洲市民们的憧憬对象。但是，在一个暴风雨的晚上和宿敌「怪盗帝国」的战斗途中4人突然失去了Toys从而命运开始发生了巨大转变…

本作的舞台是活跃着怪盗与侦探的近未来架空世界里的“侦探之都横浜”。世界上有着被称为“TOYS”的特殊能力，侦探与怪盗之间使用“TOYS”能力相互战斗着，这个时期被称为“大侦探时代”。作品讲述的是在二十一世纪这个“大侦探时代”中，以侦都横浜为舞台，4名立志成为名侦探的少女与曾经是侦探的青年的故事。